Эмин Эльдар оглы Амруллаев родился 30 декабря 1982 года.

В 1999-2003 годах учился на факультете административного управления Академии государственного управления при Президенте Азербайджанской Республики, а в 2003 году окончил это высшее учебное заведение с отличием. В 2003-2004 годах обучался в магистратуре по политическим наукам в Центрально-Европейском университете. В 2010-2012 годах при совместной поддержке «Государственной программы по обучению азербайджанской молодежи за рубежом на 2007-2015 годы» и программы «Fulbright» обучался в магистратуре по государственному (административному) менеджменту в Колумбийском университете.

В 2005-2009 годах работал преподавателем факультета международных отношений Университета «Кавказ». В 2009-2010 годах работал начальником отдела международных связей ООО «Kaspi Education». В 2011 году прошел стажировку в Европейской экономической комиссии ООН (UNECE) в Женеве. В 2012 году работал исполнительным директором Центра энергетики и окружающей среды Азербайджанской Дипломатической Академии (ныне Университет АДА). В 2013 году работал заместителем директора по контролю качества образования в ООО «Kaspi Education». С июня 2013 года начал работать старшим консультантом в Министерстве Образования Азербайджанской Республики, в 2013-2014 годах работал заведующим сектором, в 2014-2015 годах заместителем начальника отдела, а в 2015-2020 годах был заведующим отделом. С января по июль 2020 года работал директором Института Образования Азербайджанской Республики.

Распоряжением Президента Азербайджанской Республики Ильхама Алиева от 27 июля 2020 года Эмин Амруллаев назначен министром образования Азербайджанской Республики. Согласно Указу Президента Азербайджанской Республики господина Ильхама Алиева от 28 июля 2022 года «О некоторых мерах по совершенствованию управления в сфере науки и образования в Азербайджанской Республике» в целях укрепления взаимодействия науки и образования и совершенствования управления в этих областях Министерство Образования Азербайджанской Республики переименовалось в Министерство Науки и Образования Азербайджанской Республики.

В настоящее время Эмин Амруллаев продолжает свою работу на посту министра науки и образования.

С 30 ноября 2022 года является членом Наблюдательного совета профессионального футбольного клуба «Нефтчи».